Jaan Bossier ist seit 1997 Klarinettist beim Mahler Chamber Orchestra und seit 2003 auch Bassklarinettist beim Lucerne Festival Orchestra.

Im Dezember 2000 gab er sein Debüt als Dirigent des belgischen Ensembles für zeitgenössische Musik Champ d’Action, das er seitdem u. a. beim Wien Modern, dem Ars Musica Brussels, deSingel in Antwerpen, im Concertgebouw Brugge und im Museum Reina Sophia in Madrid dirigiert hat. Er nahm an Dirigier-Meisterkursen bei Jorma Panula teil und erhielt Privatunterricht von Pierre Boulez und Zsolt Nagy.

Er ist Mitgründer und Dirigent des Ensembles 306, ein Ensemble für zeitgenössische Musik in Eindhoven.

Zusammen mit Solisten des Mahler Chamber Orchestra sowie Rainer Honeck (Konzertmeister der Wiener Philharmoniker), dem Pianisten Christoph Berner und Solisten des WDR Symphonieorchesters Köln spielt er Kammermusikkonzerte in Deutschland, den Niederlanden, Belgien, Frankreich, Italien, Österreich, der Schweiz, Spanien und Japan.

Jaan Bossier ist zudem Gründer und Klarinettist des Kammermusikensembles Particella.

Jaan Bossier spielte u. a. im Chamber Orchestra of Europe, bei der Deutschen Kammerphilharmonie Bremen, im Orchestra Mozart (Bologna), dem Orchester des Staatstheaters Darmstadt, der Camerata St. Petersburg, dem Lithuanian Chamber Orchestra und in Het Brabants Orkest.

Seit 2009 hat Jaan Bossier einen Lehrauftrag an der Musikhochschule in Bremen.